La BIU Santé Médecine conserve un ensemble important des thèses de médecine soutenues à la Faculté de médecine de Paris depuis 1539 qui constitue une collection unique au sein des bibliothèques universitaires françaises et exhaustive pour le XIXe siècle. Elle conserve également les thèses de médecine du XIXe siècle soutenues dans d’autres facultés françaises de médecine comme des thèses de médecine de Toulouse, de Bordeaux, de Montpellier, de Lyon, de Strasbourg ou de Nancy. Un ensemble encore partiel des thèses de médecine du XIXe siècle est déjà en ligne dans Numerabilis. Elles sont progressivement numérisées en fonction des besoins et des demandes des chercheurs.