Il existe à la BIU Santé deux collections complètes des thèses de chirurgie depuis 1749. La plus ancienne collection a été créée par Pierre Süe, ancien prévôt du Collège de Chirurgie et premier bibliothécaire de l’École de Santé. Il a recueilli les thèses et les a classées en les numérotant une à une, tout en portant en marge de nombreuses annotations. Cette collection contient 238 thèses pour une période de quarantaine années. La collection Arrachart la complète. Les thèses sont composées de propositions d'anatomie et de chirurgie sur un sujet donné. Elles étaient imprimées dans un format in-quarto et agrémentées parfois de gravures.